Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
TrabdQ99JY4 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
TrabdQ99JY4 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms