Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ddb2Q99J79 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms