Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm42689-201ENSMUST00000202403 404 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hecw1Q8K4P8 3930402G23Rik-202ENSMUST00000208615 581 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.5 ms