Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Abcf3Q8K268 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Abcf3Q8K268 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms