Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Cdkl1Q8CEQ0 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms