Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fbxo48Q8CAT8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms