Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms