Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWR4

Usp40, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp40Q8BWR4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Usp40Q8BWR4 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp40Q8BWR4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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