Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Atg4bQ8BGE6 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Atg4bQ8BGE6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms