Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm11554-201ENSMUST00000105056 890 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Rasl11a-201ENSMUST00000031646 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Shq1Q7TMX5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm11996-201ENSMUST00000117538 915 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm39397-201ENSMUST00000212331 228 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Shq1Q7TMX5 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Shq1Q7TMX5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Shq1Q7TMX5 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms