Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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Ubfd1Q78JW9 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Ubfd1Q78JW9 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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