Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
JrkQ60976 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
JrkQ60976 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms