Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm6899Q3USS0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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