Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Nhlrc4Q3UP44 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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