Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Skap2Q3UND0 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Skap2Q3UND0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms