Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 1700088E04Rik-210ENSMUST00000190509 871 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Puf60Q3UEB3 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms