Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Q3U6N9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.3 ms