Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Rnf149Q3U2C5 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms