Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rundc1Q0VDN7 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rundc1Q0VDN7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms