Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T7

Cntnap5c, Contactin-associated protein like 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5cQ0V8T7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cntnap5cQ0V8T7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cntnap5cQ0V8T7 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms