Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm45012-201ENSMUST00000208323 1666 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC162932.1-201ENSMUST00000219209 872 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ttc21bQ0HA38 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms