Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
AmbpQ07456 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
AmbpQ07456 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms