Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Siah1bQ06985 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Siah1bQ06985 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms