Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Thbs3Q05895 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
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