Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hoxd1Q01822 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms