Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Mc1rQ01727 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Mc1rQ01727 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms