Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm22495-201ENSMUST00000104492 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 4930553M12Rik-201ENSMUST00000057837 498 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Hmox1-201ENSMUST00000005548 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Grin2bQ01097 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grin2bQ01097 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms