Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Rbp4Q00724 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rbp4Q00724 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms