Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC6.52□□□□□ -1.36
Rps29P62274 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Rps29P62274 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms