Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Tmod1P49813 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tmod1P49813 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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