Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VdrP48281 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
VdrP48281 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
VdrP48281 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
VdrP48281 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms