Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
PtgfrP43117 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.3 ms