Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
RxraP28700 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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