Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PparaP23204 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PparaP23204 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PparaP23204 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms