Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Pou5f1P20263 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Pou5f1P20263 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms