Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Irf1P15314 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Irf1P15314 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Irf1P15314 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rd3l-202ENSMUST00000185354 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Irf1P15314 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
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