Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01735 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01735 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01735 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01735 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01735 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01735 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
P01735 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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