Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Lnx1O70263 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms