Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
DffaO54786 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
DffaO54786 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
DffaO54786 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms