Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Dgcr6O35347 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Dgcr6O35347 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms