Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm8888J3QPX5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm8888J3QPX5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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