Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Smim18J3QNP2 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gad1-201ENSMUST00000094934 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Mrpl51-201ENSMUST00000032485 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Smim18J3QNP2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Smim18J3QNP2 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 C230021G24Rik-201ENSMUST00000181196 3679 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim18J3QNP2 Rapgef4os2-201ENSMUST00000128165 2116 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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