Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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Gm20830J3KML6 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Gm20830J3KML6 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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