Protein–RNA interactions for Protein: F8WIA3

Gm20604, Predicted gene 20604, mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20604F8WIA3 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Adamtsl2-201ENSMUST00000091233 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Hpgds-201ENSMUST00000031982 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gpr50-201ENSMUST00000070449 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm26816-201ENSMUST00000180679 2448 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm37962-201ENSMUST00000195535 2034 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm18259-201ENSMUST00000220991 2010 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tubd1-205ENSMUST00000167178 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Vmn1r-ps128-201ENSMUST00000121211 1739 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Setd7-201ENSMUST00000037141 7411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Rnf41-202ENSMUST00000171342 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Arid1b-203ENSMUST00000115799 9888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm16287-201ENSMUST00000097827 2324 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Itga10-201ENSMUST00000029744 5044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm26574-201ENSMUST00000181876 2141 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
Gm20604F8WIA3 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms