Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm12943-201ENSMUST00000119616 210 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ScaperF8VQ70 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms