Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm5294-201ENSMUST00000179205 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf11E9PZM7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms