Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc175E9PVB3 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms