Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Kif28pD3YXS5 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms