Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Phf11cB4XVP9 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Phf11cB4XVP9 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms