Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Vmn1r37-206ENSMUST00000228791 1617 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Psph-202ENSMUST00000118268 785 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm43178-201ENSMUST00000197257 1386 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Prr29B1ARI9 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Olfr1115-201ENSMUST00000081986 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Gm26734-201ENSMUST00000181769 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prr29B1ARI9 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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